本申请涉及一种金银合金纳米线的透射电子显微镜表征方法，所述方法包括：步骤S1：配置金银合金纳米线种子；步骤S2：获得贵金属包覆的核壳纳米线溶液；步骤S3：获得纯化分离后的贵金属包覆的核壳纳米线溶液；步骤S4：将所述纯化分离后的贵金属包覆的核壳纳米线溶液制备为STEM样品或TEM样品；步骤S5：获得样品的透射电镜采集数据；步骤S6：对所述样品采集数据进行三维重构和定量计算。本申请通过在金银合金纳米线表面包覆一层贵金属的纳米层以及样品制备，对一系列断层扫描图片的三维重构以及定量计算，可以有效的减少电子束对金银合金纳米线的损伤，增加金银合金在电子束轰击下的稳定性，得到更加精准的金银合金纳米线结构的形貌表征。