本申请涉及一种三维脑肿瘤分割方法、装置、计算机设备和存储介质。所述方法包括获取脑肿瘤MRI三维影像；将双路径序列注意力机制以及结构重塑注意力机制融入至通用卷积神经网络3D‑Unet或面向三维MRI影像脑瘤分割的UNETR中，得到改进的3D‑Unet网络或改进的UNETR，将脑肿瘤MRI三维影像输入到改进的3D‑Unet网络或改进的UNETR中，得到脑肿瘤分割结果；双路径序列注意力机制用于提取不同脑部MRI序列中包含的关键特征；结构重塑注意力机制用于引导模型更高效的找出需要重点关注的区域。采用该方法可以实现不同序列下的特征信息融合，实现连续切片之间局部特征的提取，提高三维医学影像的识别准确度。