本发明公开了一种水平井钻井轨迹构建方法，包括于构造井位图，以水平井井口为原点、沿水平井的延伸方向绘制坐标轴，读取得到关键井的坐标、目的层砂体顶面海拔数据组及目的层砂体底面海拔数据组；绘制预测砂体顶面线及预测砂体底面线，得到沿水平井的延伸方向的砂岩剖面模型图；根据水平井的设计轨迹数据及靶点数据于砂岩剖面模型图绘制设计轨迹，得到叠合轨迹图；于叠合轨迹图得到预测着陆点；根据预测着陆点的海拔于实钻录井图校深，得到实际着陆点的海拔；根据实际着陆点和预测着陆点的位置关系对设计轨迹进行修正，得到调整轨迹，并于调整轨迹得到调整靶点。其能够解决由于构造预测误差、钻具深度与测井深度误差造成靶点偏移误差的问题。