本发明提供了一种考虑新能源不确定性的电力系统概率碳流处理方法，属于能源排放核算技术领域。首先，引入实际的风力和辐射强度分布，通过风力发电机的风力‑功率关系式和光伏发电机的辐射强度‑功率关系式，得到风力发电机和光伏发电机的功率概率密度函数；其次，将发电机出力与负荷相结合，建立节点概率注入功率模型；然后，引入碳排放流理论，建立电力系统概率碳流计算模型；最后，引入拉丁超立方采样，构建了一种考虑新能源不确定性的电力系统概率碳流计算方法。本发明充分考虑了电力系统中新能源发电机的出力存在不确定性的问题，为未来高精度的碳流计算，以及后期碳责任分摊和低碳响应的研究奠定了基础。