本发明设计GPU调度领域，公开了基于GPU集成的云计算硬件加速控制系统及方法，包括如下步骤：根据GPU集群节点包括的GPU单元的状态和参数，得到对应GPU集群节点的参数和状态；算力容器构建模块根据算力任务请求的算力以及各GPU集群节点预计释放时长，得到预计最小释放时长，根据预计最小释放时长包含的GPU集群节点，建立对应算力任务的GPU集群节点列表；将对应算力任务的算力容器信息发送到对应算力任务的GPU集群节点列表中的各个GPU集群节点的算力任务执行序列；GPU集群节点执行完一个算力任务后，连接到对应算力任务的算力容器，完成基于GPU集成的云计算硬件加速控制。通过本发明，可以实现对GPU集群节点进行灵活调度，能够满足不同的GPU算力需求。