本发明公开一种梯级水电站群多尺度多元市场电量分配方法，其根据结算规则将月度及日前市场统筹考虑为月度市场交易；将保量保价、保量竞价统筹考虑为优先发电计划电量，从而将原始多市场、多尺度、多品种电量分配问题转换为不同交易品种组合的分配问题；在此基础上，构建以梯级年度总收益最大为目标，考虑水力约束以及送电比例、年度签约比例等政策性约束的数学模型，采用混合整数规划模型实现高效求解；本发明能够快速得到梯级水电站在区域和省级不同市场、不同月份、不同交易品种的电量优化配置结果，提高梯级水电的发电收益。