本发明属于医学图像标注，具体涉及一种医学序列图像标注方法、系统、设备及存储介质，其方法包括：获取医学序列图像；对局部偏差值医学序列图像进行首帧标注，得到非均匀B样条；基于局部偏差值非均匀B样条，引入核函数，得到广义B样条；对局部偏差值医学序列图像进行特征配准，得到特征点对；基于局部偏差值特征点对，得到局部偏差值医学序列图像的平均偏差值；基于局部偏差值平均偏差值，调整局部偏差值核函数参数，得到修改广义B样条；基于局部偏差值修改广义B样条，调整标注点，得到下一帧图像的B样条准插值闭合曲线。本申请具有在首帧手工标注图像的指引下，实现后续帧图像的自适应标注的效果。