本发明提供了一种基于shapiro时延和周期性相对论效应改正方法，包括以下步骤：读入掩星观测时间；读取LEO精密星历文件，用以获取LEO的位置；读取GNSS精密星历文件，用以获取掩星和参考星的位置；修正传播延迟并重算掩星和参考性位置；根据插值得到的掩星和参考星的位置，分别计算掩星和参考星到地心之间的几何距离；由引力时延公式计算出shapiro时延误差；模型公式计算周期性相对论效应误差；计算得到相对论效应改正量。本发明有益效果：引入shapiro时延和周期性相对论效应误差改正算法，提升掩星大气弯曲角、折射率、温度、湿度、压强等廓线产品精度，保证其质量满足数值预报精度要求。