本发明公开一种光伏组件自动合托系统及合托方法，系统包括：动合托设备、链条机和母托盘，链条机用于传输光伏组件和母托盘，自动合托设备用于实现光伏组件自动合托至母托盘中；自动合托设备包括：支撑驱动机构、配重机构、提升机构和底座；支撑驱动机构设置在底座上，配重机构和提升机构均设置在支撑驱动机构上，配重机构与提升机构传动连接，提升机构用于叉取光伏组件；支撑驱动机构带动配重机构和提升机构沿着底座进行水平方向的移动，在配重机构的辅助下，提升机构带动光伏组件沿着支撑驱动机构进行竖直方向的移动，实现光伏组件自动合托。本发明具有结构紧凑、操作简便、自动化程度高、兼容性高且稳定性佳等优点，提高了光伏组件的存储效率。