本发明公开了一种功率器件的热管理优化设计方法及系统，该方法包括以下步骤：S1、建立热管理体系，所述热管理体系包括逆变器、功率器件；S2、获取热管理前功率器件的寿命消耗；S3、基于所述寿命消耗确定所述温度控制目标的类型；S4、在所述类型下设定温度控制目标的幅值，进行热管理，计算热管理后的寿命提升率；S5、重复步骤S4，直至得到最大寿命提升率，将最大寿命提升率对应的温度控制目标设为该类型下的最终目标。本发明一种功率器件的热管理优化设计方法及系统具有温度合理控制、延长寿命的特点。