本发明公开了一种柔性直流输电系统的不对称短路识别方法，涉及电网运维领域；目前，不对称短路故障识别，普遍存在识别效率、准确性不能兼顾的问题。本发明包括步骤：计算两侧保护安装处的负序电流幅值；当交流侧负序电流幅值小于整定值时，认为系统正常运行或发生三相短路故障，当交流侧负序电流幅值大于整定值时，认为系统发生不对称故障，计算两侧保护安装处负序电流突变量的幅值之差；若幅值之差大于整定值，则认为存在不对称故障，且短路故障发生在对应两侧保护安装区内，继电保护动作；否则，认为为穿越性电流，故障发生在两侧保护安装区外或为正常运行状态，继电保护不动作。本技术方案可以更快速、更准确地识别不对称短路故障。