本发明公开了一种胃间质瘤在胃超声内镜下的病灶自动标注识别装置，涉及超声图像分析技术领域，包括：第一训练模块，用于基于预设超声胃镜图像集对第一预设卷积神经网络进行训练，得到训练好的二分类器；处理模块，用于对预设超声胃镜图像集中的每个超声胃镜图像进行滑块遮挡处理，同时基于训练好的二分类器进行二分类识别，得到每个超声胃镜图像对应的感兴趣区域图；第二训练模块，用于以预设超声胃镜图像集和预设超声胃镜图像集中每个超声胃镜图像对应的感兴趣区域图对第二预设卷积神经网络进行训练，得到训练好的识别模型；识别模块，用于基于训练好的识别模型，对待标注超声胃镜图像进行关于胃间质瘤的感兴趣区域标注识别。