本发明提供一种多模通信系统的代理变更方法及多模通信系统，属于通信技术领域；多模通信系统包括站点和代理协调器；该方法包括：目标站点向当前代理协调器发送报文；其中，报文包括业务报文和探测报文；当前代理协调器基于报文向目标站点反馈报文确认信息；目标站点基于报文确认信息和各通信模式的权重更新当前代理协调器的期望传输时间；其中，报文确认信息包括业务报文确认信息和探测报文确认信息；若更新后的期望传输时间大于预设阈值，则进行代理变更。本发明能够判断出路径变差和通信成功率变低的情况，可以通过调节权重，加强对重点通信模式的路径监测，能够及时进行代理变更，从而提高通信系统的可靠性和实时性。