一种富含抗氧化活性的蓝莓乳酸菌发酵饮料及其制备方法，为了解决现有的植物乳酸菌饮料多为调配型，不含植物功能性成分，没有能够适应蓝莓果汁酸性环境和高浓度多酚，并能高效转化结合态多酚的乳酸菌株，营养价值低，生物利用度低，抗氧化活性低，营养不能达到最大化的问题，本发明包括蓝莓果汁、种子发酵液、稳定剂，通过按照菌种筛选；确定菌种比例；蓝莓原料处理；菌种驯化；果汁酶解；灭酶、杀菌；接种；调配；杀菌、热灌，的方法进行制作，通过从自然发酵物中筛选菌种，提高了蓝莓果汁中多酚物质的体外生物利用率，强化抗氧化活性，使蓝莓果汁的营养价值最大化，形成一款兼具风味与营养的饮料产品。