本发明公开了一种轨道车站变形缝止水密封结构，包括混凝土保护层和设于其中的变形缝，所述变形缝内装填有变形缝衬垫板，变形缝的缝口设置有可拆式止水结构，可拆式止水结构的两边设置有压边组件。本发明中变形缝衬垫板、泡沫棒、双组分聚硫密封胶和未流化丁基橡胶腻子片依次起到第一、第二、第三和第四道密封作用，内夹布和覆布层组成密封布起到第五道密封作用，通过五道密封可完全应对侧墙渗漏水从变形缝渗出的情况，同时，旋转螺栓驱动压板靠近，压板以圆钢作用支点，轻微转动即可使压块紧压齿形条，对可拆式止水结构边部进行密封，既起到密封作用，又能保证可拆式止水结构不会因水压作用而产生位移，保证止水密封的稳定性。