本申请公开了柴油机气缸健康状态监测方法、系统和存储介质，属于柴油机气缸健康状态监测技术领域。方法用于监测所述柴油机气缸的健康状态，包括采集柴油机气缸在当前工况下的运行特征参数；基于运行特征参数，通过预定的预测模型预测获得柴油机气缸的油液参数、热工参数和振动特征参数；根据预测获得的油液参数、热工参数和振动特征参数，与实际油液参数、实际热工参数和实际振动特征参数进行残差计算，确认残差结果；根据残差结果，确认柴油机气缸的健康状态。本方法不需要对柴油机做任何结构或系统的改变，仅需采集已有的运行特征参数，减少了对柴油机的干扰，同时可以真实全面地评估柴油机气缸的健康状态，也方便实时监测和长期监测的应用。