本发明涉及一种高压泵比例阀控制方法及系统，根据最优专家集合及该时刻的目标输出压力，获得该时刻的最优输入值，所述输入值为电流值或者电压值，并输入高压泵的比例阀中，获取所述最优专家集合的方法为：获得初始专家集合，所述初始专家集合包括预测时域内的所有时刻所对应的初始输入值和目标输出压力；更新所述初始专家集合：根据实际输出压力以及对应的目标输出压力的差值，调整初始输入值，直至实际输出压力符合预设条件，将调整后的初始输入值更新为最优输入值，储存至初始专家集合中，所述实际输出压力根据输入值计算得到；重复更新所述初始专家集合。本发明实现精确控制输入电流或者电压的目的。