本发明提供一种近零碳园区综合能源系统数学‑信息模型运行方法及系统，应用于园区综合能源系统建模技术领域。近零碳园区综合能源系统数学‑信息模型运行方法包括从近零碳园区综合能源系统的物理实体中，获取物理实体的数据；根据数据对应的数据类型和处理方式，对数据进行处理，生成输入量数据集；将输入量数据集传输给数学模型；接收数学模型返回的输出量和中间量；根据输出量生成输出量数据集，根据中间量生成中间量数据集；根据输出量数据集和中间量数据集对物理实体进行控制。本发明从数据流角度给出了中间量在数学模型和信息模型间的交互流程，使其能够返回信息模型，解决了中间量返回信息模型过程中的数据传输问题。