本发明提供了一种羟基保护中间体的制备方法、磷脂酰乙醇胺类化合物及其制备方法。该羟基保护中间体的制备方法包括：步骤S1，将包括化合物1、卤化硅烷试剂、第一催化剂的第一原料进行取代反应，得到化合物2；步骤S2，将包括化合物2与酸性试剂的第二原料进行脱丙叉保护反应，得到化合物3，即羟基保护中间体。通过确保不饱和羧酸的不饱和双键不被破坏和显著抑制酯迁移杂质的产生，从而提高了磷脂酰乙醇胺类化合物产品的质量，同时，该工艺采用了比较温和的试剂和反应条件，并且操作简便，适合工业化放大生产，降低了成本。