本发明属于农业废弃物处理领域，具体涉及一种菠萝渣废弃物的处理方法，包括如下步骤：步骤1：将菠萝渣中的菠萝的表皮、菠萝叶粉碎、干燥、膨化，然后采用纤维素酶和/或半纤维素酶进行发酵，得到第一发酵产物；步骤2：将菠萝渣中的废弃的果肉、碳源、氮源混合并接种复合菌进行发酵，得到第二发酵产物；步骤3：将第一发酵产物、第二发酵产物混合并持续发酵，得到第三发酵产物。该方法通过两步发酵后，将发酵产物进行混合发酵，对初步降解后的菠萝皮/叶进行进一步发酵处理，其发酵效率较高，内含营养成分较多。同时，本发明还提供基于该方法的发酵产物和应用。