一种基于数字孪生的实时县域能源互联网调度方法及系统，方法包括以下步骤：对预先建立的县域能源互联网调度模型进行约束，得到实际工况调度模型；以实现调频指令输出与实际功率输出之间的总功率偏差最小，建立目标函数；根据目标函数，结合自回归综合移动平均模型与平衡优化器算法，对实际工况调度模型进行求解，获得最佳的实时县域能源互联网调度方案。当主电网接收到随机扰动时，从主电网向县域能源互联网调度模型传输总调节命令；县域能源互联网调度模型通过求解最佳的实时县域能源互联网调度方案，将总调节命令下发给各个调频单元。本发明考虑了当前和未来的时间控制间隔，利用自回归综合移动的平衡优化器算法可以高效地获取最佳的协同控制方案。