本申请提供一种脂肪酸生物饲料生产监控系统的故障诊断方法，本申请通过获取脂肪酸生物饲料生产流程中的故障监测节点，确定用于故障诊断的目标生产调度链路，并利用该链路的运行变迁信息和装置级作业数据，调整生产轨迹并输出故障诊断数据。这种方法能够有效地在生产全域视野下追踪和分析故障监测节点对应生产环节的生产轨迹，同时结合装置级作业数据所反映的生产层级交互情况，精准地诊断出故障节点和故障原因，从而可以显著提高脂肪酸生物饲料生产流程的故障诊断效率和准确性，降低生产过程中的故障率和成本损失，为生产过程的优化和稳定提供有力支持。