本发明提供了一种基于零净距双洞法隧道中墙保护及减振施工方法，包括：施工先行洞并向后行洞方向扩挖，将后行洞开挖岩体与先行洞结构分离形成隔振空气层；施工中墙；在后行洞开挖岩体与中墙之间布置防爆破飞石冲击装置；后行洞上台阶两部爆破开挖；上台阶两部开挖分为远离先行洞开挖断面及靠近先行洞开挖断面；后行洞下台阶两部爆破开挖，分为远离中墙开挖断面及靠近中墙开挖断面。本发明所耗费的时间和经济成本较低，后行洞爆破开挖效率较高，经现场实际测试减振效果良好，有效保护了先行洞二次衬砌安全，同时可以充分保护中间加强层免受爆破飞石冲击，具有很好的推广应用价值。