本发明属于汽车技术领域，具体涉及一种基于超单元的汽车部件疲劳分析方法及系统。该方法包括以下步骤：建立目标车辆整车的有限元模型；将有限元模型划分为超单元和残余结构两个部分；对超单元进行动态缩聚，得到H3D文件；基于H3D文件，对残余结构进行频响分析，得到频响应力，保存在频响分析结果文件中；获取目标车辆的实际加速度时域信号，并将其转换成功率谱密度；基于频响分析结果文件和功率谱密度获取残余结构的疲劳损伤结果；对疲劳损伤结果进行计算转换，得到目标车辆上相应部件的疲劳分析结果。本发明提供的一种基于超单元的汽车部件疲劳分析方法及系统，能够减少计算量和计算时间、降低出现不易察觉错误的可能性、提高工作效率。