本发明提供了一种基于轻量化抗多普勒射频指纹识别的方法，属于物联网安全信息技术领域。本发明包括结合I/Q信号特点，将信号表示转换为时频图，保留时域和频域射频指纹特征，构建去信道化的差分频谱图；并采用多普勒信道建模合成更多数据集的方式，使模型能够通过获取更多的多普勒频移环境下的射频信号进行数据增强提取更多可靠的射频指纹特征。此外，还设计了一种新的轻量化深度卷积可分离网络。本发明的识别模型由输入层，卷积层，多个深度可分离卷积层，最大池化层，全连接层以及softmax分类层组成。该方法能增加模型的推理速度，提高模型识别准确率，实现资源受限下低成本绿色环保通信识别。