本发明公开了一种二维城市冠层温室气体通量评估技术，涉及区域尺度温室气体通量评估技术领域，用于实现高时间分辨率的区域大气温室气体通量的估算。该技术可以解决传统方法角度中，IPCC自下而上的估算十分依赖能源统计数据本身的准确性和全面性，而大多数城市仍不具备使用这种方法的条件的问题。本发明从大气观测角度整合温室气体在线观测数据、风廓线雷达数据、微波辐射计数据和地面气象站数据等多源气象环境观测数据，进行质量控制，构建高精度数据集，基于二维箱式模型估算城市冠层水平温室气体浓度梯度和垂直通量，提供区域碳收支检测的新方案。