本发明提供一种膨胀土地层同轴嵌套多段沉井结构及减阻助沉施工方法，所述沉井结构包括外套井和内套井，其中，所述外套井套设在所述内套井的外围，所述外套井和所述内套井共轴，所述内套井的下端低于所述外套井的下端；所述外套井的下端具有刃脚，所述内套井的上端位于所述外套井的刃脚的上方；所述外套井的内壁上设置有若干限位固定器，所述限位固定器内设置有对中限位减阻球。该沉井结构通过气液减阻系统向第一竖向助沉管和第二竖向助沉管注入高压气体、水或泥浆，高压气体、水或泥浆沿着外套井的井壁上升形成气幕或减阻帷幕，实现对沉井减阻助沉的目的，外套井和内套井采用同轴嵌套结构能够显著降低内套井所受的沉井阻力。