本发明公开了一种基于源荷不确定性的区域多能互补能源系统优化调度方法，包括，1，确定基于源荷不确定性的区域多能互补能源系统的主要设备，搭建系统结构图；2，建立风电、光伏、储电池、燃气轮机、ORC余热回收装置和储热罐的数学模型，以及内部电网、热网的功率平衡约束方程；3，以系统综合碳排放量最小为目标，计及不同区域综合能源站之间的交互，考虑基于源荷不确定性的区域多能互补能源系统的优化调度。本发明采用信息间隙决策理论处理荷端不确定性，能更加合理的对区域多能互补能源系统进行调度，从而能提高系统的抗干扰能力并降低系统的综合碳排放量。