本发明涉及船用设备技术领域，尤其涉及一种港湾内河散装液化气船舱压控制方法及系统，其方法包括如下步骤：规划相应港湾内河运输航线，建立立体移动风险区通道；采集航线周围邻近区域环境信息数据，并测算立体移动风险区通道与邻近航线或水上建筑物的最小距离；进行散装液化气船与邻近航线航行船舶及航线周围建筑物危险区预干涉分析，并进行风险定级；确定散装液化气船航速以及蒸发气消耗设备功率，使舱压保持所需恒定压力；根据确定的相应港湾内河运输航线情景按照确定的散装液化气船航速、蒸发气消耗设备功率进行管控。本发明提供的方法及系统提高了散装液化气船的自我安全风险管控能力，降低了港湾内河区域风险。