本发明提供一种水平分支孔注浆量预测方法及系统，包括：进行水文地质调查，获取地层信息，确定水文地质特征；基于获取的水文地质特征进行第一漏失段试验，完成第一次抽水试验和第一次压水试验，通过预设的预测模块进行注浆量第一次预计并对预测模型进行修正；多次重复漏失段试验，对预计注浆量经验公式继续进一步精确修正，建立更为准确的预测模型；经过多次试验与修正，直至预测模型更贴近实际工程情况，预测注浆量与实际注浆量误差不超过设定阈值，确定预测模型。本发明解决了现有水平分孔注浆量难以准确预测的问题。