本发明公开了一种用于治疗动物皮肤病的药物组合物及其制备方法,包括药液成分和微囊成分，所述药液成分内溶解含有抗真菌、抗菌、抗炎、抗过敏的药物，所述微囊成分以微囊的形式置于药液成分中，构成具有二次释放药效的药物组合物,药液成分为水溶性的凝胶，所述微囊成分为油性的液滴，所述液滴的外层包裹一层具有刚性和稳定性蛋白质,药液成分中所溶解的药物包括抗真菌药酮康唑、抗菌药阿奇霉素、抗炎药苯海拉明和抗过敏药氯雷他定，所述药物按比例分别溶解在所述药液成分和微囊成分中。构成了一种具有高效、安全、持久的特点的药物组合物，可用于治疗动物的皮肤真菌感染、皮肤炎症、皮肤过敏等症状。