Invention Grant
- Patent Title: 一种基于迁移学习的TCR-表位结合预测方法及系统
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Application No.: CN202410161424.XApplication Date: 2024-02-05
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Publication No.: CN118016158BPublication Date: 2024-08-23
- Inventor: 杨森 , 杨泽熙 , 卢嘉毅 , 聂琪 , 倪嘉琦
- Applicant: 常州大学
- Applicant Address: 江苏省常州市武进区滆湖中路21号
- Assignee: 常州大学
- Current Assignee: 常州大学
- Current Assignee Address: 江苏省常州市武进区滆湖中路21号
- Agency: 南京禹为知识产权代理事务所
- Agent 颜丹佳
- Main IPC: G16B30/00
- IPC: G16B30/00 ; G16B40/00 ; G06N3/0455 ; G06N3/096
Abstract:
本发明公开了一种基于迁移学习的TCR‑表位结合预测方法,包括:获取TCR序列数据集,对所述TCR序列数据集进行数据处理,通过对TCR序列过滤得到表位序列,通过动态训练策略得到训练集和测试集;训练自回归编码器模型和ProtBert模型,并对TCR序列和表位序列进行特征提取,得到TCR序列特征和表位序列特征;对所述TCR序列特征和表位序列特征通过二维直方图进行数据转换,并输入到二维卷积网络中输出向量,将输出向量输入到全连接网络,得到第一输出向量,同时将二维卷积网络中输出向量合并,得到第二路网络;将第一输出向量和第二路网络通过多头注意力策略合并,对合并向量进行扁平化处理,得到全连接网络的输入,提高了TCR‑表位结合任务的预测准确性。
Public/Granted literature
- CN118016158A 一种基于迁移学习的TCR-表位结合预测方法及系统 Public/Granted day:2024-05-10
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