本发明涉及一种脱氨酶突变体及其应用，所述脱氨酶突变体是由SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列发生突变得到的，所述突变至少包括如下突变位点中的一个：第60位由L突变为A或V，第100位由S突变为A或T，第170位由G突变为S或C，第200位由E突变为K或H。该脱氨酶突变体应用于核苷类化合物，催化活性高，稳定性好，相比野生型脱氨酶均有不同程度的提高。与化学合成方法相比，其所催化的反应简单温和，反应选择性高，制备成本低，具有较好的应用前景。