本发明公开了一种流域防洪智能优化预报方法，包括以下步骤：在湿润地区选取一处流域，收集流域相关特性数据及典型历史降雨径流过程资料；构建适合流域的概念水文模型；在逆变换法改进洗牌复形演化算法的基础上，提出变异精英策略，进一步改进洗牌复形演化算法：即变异精英‑逆变换‑洗牌复形演化算法；基于变异精英‑逆变换‑洗牌复形演化算法，优化概念水文模型；通过输入流域实时或气象降雨过程，获取流域实时或气象预报径流过程。本发明的优点是：利用变异精英策略进一步改进洗牌复形演化算法，在保留算法已有的优势特性下，进一步加强了算法的稳定性、可靠性和准确性，提升了算法搜索效率和寻优能力，为流域防洪智能优化预报提供新方法。