一种基于模域回路理论的输电线路合闸过电压计算方法及系统，所述方法包括：采用相域串联阻抗矩阵、并联导纳矩阵和电压转换矩阵迭代计算电缆线路的频变参数和计算频率；当相邻两次计算得到的计算频率差值小于设定阈值时，将当前计算频率选定为主导频率，并获得频变参数；采用模域回路理论解耦相域下电缆输电线路的电报方程，并获得模域下的电报方程；对获得的电报方程进行Laplace变换并带入主导频率下的频变参数进行电报方程求解，获得电缆线路沿线模域和复频域下的合闸过电压结果；对电缆线路沿线模域和复频域下的合闸过电压结果进行Laplace逆变换和相模逆变换，获得电缆线路沿线时域和相域下的合闸过电压计算结果。本发明提高了过电压计算算法计算速度。