本发明提供了一种烟草病虫害识别方法、介质及系统，属于烟草病虫害识别技术领域，包括：根据害虫以及烟草图像，获取病害烟草图像特征、病害烟草红外图像特征、虫害烟草图像特征以及虫害烟草红外图像特征，融合为三个特征，对三个特征进行注意力识别分析，得到融合特征矩阵；采用融合特征矩阵及其对应的已知烟草害虫或已知病害或已知虫害作为训练数据集，训练一个神经网络，得到烟草病虫害识别模型；获取待测烟草的每个部位的图像和红外图像，融合得到待测融合图像，利用烟草病虫害识别模型输入待测融合图像，得到病虫害识别结果。解决了现有技术利用图像识别的方式对烟草病虫害进行识别过程中，存在对病虫害识别准确度差的技术问题。