本发明涉及一种用于操作燃料电池系统的方法，所述燃料电池系统包括一个或多个燃料电池(10)和具有冷却流体以用于在使用期间冷却所述一个或多个燃料电池的冷却系统(20)，所述方法包括：‑获得(S1)所述燃料电池系统(1)的关闭请求；‑预测(S2)未来关闭时间段；‑响应于检测到所述未来关闭时间段短于所述一个或多个燃料电池(10)的预定劣化时间窗口(TW)，操作(S3)所述冷却系统以便降低所述一个或多个燃料电池(10)的温度。本发明还涉及一种控制单元(30)、一种燃料电池系统(1)、一种车辆(100)、一种计算机程序以及一种计算机可读介质。