本发明提供一种氰根离子的检测方法及其应用，(1)待测样品与衍生试剂反应，得到供试品溶液；所述衍生试剂结构如式I所示，其中，R1为亚苯基或C4‑C8亚杂芳基；R2为C1‑C4直链或支链亚烷基；R3、R4、R5各自独立地选自C1‑C3直链或支链烷基；(2)取步骤(1)得到的供试品溶液进行高效液相色谱‑质谱检测，得到特征谱图。本发明将待测样品与衍生试剂反应，衍生产物在高效液相色谱‑质谱检测中定量限≤1.2ppm，该方法操作简单，对氰根离子选择性好、灵敏度高、准确度高，可以广泛应用于有机或者无机化合物中氰根离子的痕量检测。