本发明属于高速磁悬浮电机的技术领域，具体涉及一种高速磁悬浮电机散热系统，其中包括磁悬浮电机体、散热机构以及智能散热系统，所述磁悬浮电机体包括壳体、电动机、定子、转子、悬浮系统以及控制系统；所述电动机、定子、转子、悬浮系统以及控制系统均设置于壳体的内部，所述散热机构包括腔室、电动马达；所述腔室包括散热网、扇叶、齿盘；所述腔室固定安装于壳体的前侧，且前方为开口状，所述散热网固定安装于腔室的内壁前侧，所述电动马达固定安装于电动机的前侧，且位于腔室内，所述齿盘与电动马达的输出端固定，该装置解决了当前高速磁悬浮电机散热效果差，散热不充分，导致高速磁悬浮电机运行不稳定甚至损坏的问题。