本发明涉及一种隧道基槽边坡清淤系统及其施工方法和清淤方法，上述清淤系统包括：输水管道，沿基槽边坡向外延伸铺设，输水管道的进水口与送水泵连通；隔板，沿输水管道间隔铺设于输水管道上，相邻隔板间安装有吸水泵，吸水泵的进水口与输水管道连通；输泥管道，沿隔板铺设于隔板上，输泥管道的出泥口通过滤泥袋与吸泥泵连通，输泥管道上铺设有滤布，吸水泵的出水口与输泥管道连通；以及隔墙，沿输泥管道间隔安装于输泥管道上，隔墙的一侧侧壁上安装有淤泥漏网，滤布的底部延伸并安装于淤泥漏网的底部。本发明中通过组成输水冲刷系统，以清理输泥通道的同时为输送淤泥提供助力，以有效清理淤积于基槽中的淤泥，改善沉管隧道基槽回淤问题。