本发明公开了一种基于主动光源的植被指数快速采样系统与方法，所述系统包括发光组件和感知装置；所述发光组件用于向目标物发出特定光谱波段的调制光；所述感知装置包括主控制器、测距传感器和光信号采集组件，所述测距传感器用于获取其与目标物之间的距离，并传输给主控制器用于光照衰减计算，所述光信号采集组件用于接收从目标物反射回来的光束并进行处理，再将结果传输到主控制器，从而计算获得目标物的各光谱波段反射率和植被指数。与现有技术相比，本发明具有可以全天候、快速、精准地获取植物各光谱波段反射率和植被指数的有益效果。