本发明涉及连铸电磁搅拌器技术领域，具体公开了一种异形铁芯式高能连铸行波线性电磁搅拌器，包括磁轭、异形铁芯和感应线圈，磁轭为圆筒形结构；多个异形铁芯焊接于磁轭内侧，异形铁芯沿磁轭的轴线方向分层设置，每层异形铁芯沿磁轭的圆周均匀分布，异形铁芯上套设有铁芯环；感应线圈水平绕设于相邻两层异形铁芯之间。由此，能够提高电磁场使用效率，降低电磁搅拌器的发热量，增加工作面的电磁密度，提高对金属熔液的搅拌力强度，从而扩大铸坯的等轴晶区，降低偏析，提高铸坯的内部质量。