本发明属于图像分析技术领域，具体公开了一种基于图像分析的猪肺病理变化评分方法及系统，通过获取猪的胸部CT扫描图像进行图像滤波和图像分割处理，得到待检测胸部CT图像，然后用户的标注指令对待检测胸部CT图像进行调整和标注，得到标注待检CT图像，再调取标注对照CT图像与标注待检CT图像进行图像区域特征比对，确定两者之间的特征差值和相应变化参数，最终利用各项变化参数计算变化评分，以便用户根据变化评分来评估猪的胸肺部位图像特征变化程度。本发明可以通过CT图像分析的方式智能化评估猪的胸肺部位相应图像特征的变化程度，以辅助兽医学习并掌握通过CT图像进行猪肺病理变化情况判断的手段，提升兽医的诊断技能和诊断精准度。