本发明公开了一种棉籽蛋白‑杨梅单宁复合物的制备方法，包括：步骤一、将棉籽粕、抗坏血酸和H2O2溶液混合，搅拌均匀，反应一段时间后，再加入杨梅单宁，得到混合物；步骤二、将步骤一得到的混合物加入旋转双螺杆挤出机挤出，将挤出物干燥并磨成粉，得到棉籽蛋白‑杨梅单宁复合物。本发明采用自由基法实现多酚和蛋白质的结合，简单快捷，得到的棉籽蛋白‑杨梅单宁复合具有优异的抗菌、抗氧化性能；此外，本发明采用共挤出技术利用挤压机内螺杆的运输作用使物料通过模具挤出，为简化工艺，实现大规模制样提供参考。