本发明公开了一种煤矿重叠区天然气弃置井永久性封堵结构，包括一级屏障、二级屏障和三级屏障，所述生产套管的外侧轴向依次设置淡水层、煤层、盖层及产层，所述淡水层、煤层、盖层及产层依次连接，所述二级屏障的一侧与煤层和淡水层连接，所述二级屏障的另一侧和生产套管连接；所述三级屏障的一侧与产层和盖层连接，所述三级屏障的另一侧和生产套管连接。所述永久性封堵方法包括以下步骤：确定淡水层、煤层、盖层及产层的厚度设置；根据淡水层、煤层、盖层、产层的厚度，对应设置一级屏障；通过不同温度、压力、位置参数，确定二级屏障和三级屏障的各结构参数；根据确定得到的参数结果，由下至上设置二级屏障和三级屏障的各结构，完成永久性封堵。