本发明公开了一种直流蒸汽发生器二回路侧用EDTA浸泡清洗系统及方法，包括清洗箱、蒸汽发生器及废液箱；清洗箱上设置有除盐水入口及加药口，清洗箱内设置有清洗箱液位计及压力表，蒸汽发生器的主给水连接段上设置有主给水临时盲板，蒸汽发生器的主蒸汽连接段上设置有主蒸汽临时盲板，清洗箱的出口经清洗泵与主给水临时盲板上的进水口相连通，主给水临时盲板上的出水口分为三路，其中，第一路经排空阀与废液箱的入口相连通，第二路经回水阀与清洗箱的入口相连通，第三路经旁路冷却阀、冷水机组及背压阀与清洗箱的入口相连通，该系统及方法具有清洗周期短、药品及除盐水消耗低、设备体积小以及成本低的特点。