本发明公开了一种用于全刚构体系桥梁分离式过渡桥墩结构及施工方法，过渡桥墩为钢筋混凝土结构，过渡桥墩连接在主梁和承台之间，过渡桥墩包括沿顺桥向相对设置的两组墩柱组件，两组墩柱组件分别与主梁固结，通过在两组墩柱组件上设置预应力孔道，预应力绞线穿过预应力孔道并进行张拉，构成预应力过渡桥墩。本发明提出分离式过渡桥墩结构，可在保证竖向刚度的前提下，降低过渡桥墩顺桥向刚度，改善全刚构体系中过渡桥墩受力，扩大刚构体系应用范围；施工过程中过渡桥墩两组墩柱组件临时对拉预应力的施工方法能进一步改善全刚构体系中过渡桥墩受力，扩大刚构体系应用范围，达到节约支座成本，减少后期维养费用，提升经济性能的目的。