本发明公开了一种用于船舶锂电池的热失控防控系统及方法，属于船舶锂电池安全技术领域，包括锂电池组、隔离排气系统、氮气吹扫系统和热失控监控系统，锂电池组包括电池架以及排列在电池架内的N个电池模块，且电池模块设置有排气接口；隔离排气系统包括分别与各个电池模块的排气接口连通的内部连接管网，内部连接管网分别连接有一进气管道和一外部排气管道；氮气吹扫系统与进气管道接通；热失控监控系统在某个电池模块发生热失控时发出报警信号并控制隔离排气系统和氮气吹扫系统自动启动接通。本发明可防止某一锂电池热失控蔓延影响其他电池模组，并利用氮气吹扫及时排出热失控产生的有害气体并降低氧气浓度，有效抑制热失控蔓延。