本发明公开了一种高生物利用率苦荞黄酮及酚类产品制备方法，包括以下步骤：苦荞粉发酵；发酵浓缩液的制备；苦荞提取物‑β‑环糊精复合物制备；苦荞提取物‑β‑环糊精复合物加入外乳液搅拌，加入果胶溶液，磁力搅拌，冷冻干燥得到苦荞提取物‑β‑环糊精复合物‑乳清蛋白‑果胶复合体系。本发明以苦荞为原料，利用通过枯草芽孢杆菌发酵联合有机溶剂浸提提获得高浓度的苦荞黄酮和多酚。以β环糊精‑乳清蛋白/阿拉伯胶、果胶包埋苦荞提取物活性成分制备活性成分缓释放体系，体外模拟胃肠道消化评价草芽孢杆菌发酵联合有机溶剂浸提对苦荞营养物质的释放量和苦荞提取物活性成分缓释体系生物利用率。