本发明涉及植物组织培养技术领域，具体来说是一种利用丛生芽诱导百子莲多倍体的方法及应用，步骤包括：无菌体系建立、然后对无菌材料进行诱导培养，在进行染色体加倍诱导，然后依次进行形态筛选、生根培养、染色体鉴定，染色体数量大于或等于4n的生根苗即为多倍体材料。本发明采用适宜浓度的秋水仙素进行短时静置诱导，同时再用适宜浓度的安磺灵进行诱导，可将多倍体诱导率提高到48%以上，而死亡率仅为1.4%，继续培养时芽均能正常生长及生根，百子莲进行染色体加倍后，可使百子莲花型变大，花色变深，同时还可使部分品种花瓣以及花萼变宽，更具观赏性。